开发区位于长江巨龙的咽喉部位，直接接受上海“龙头”的辐射，同时长江中下游经济区域也为她提供了丰富的资源和广阔的市场；依托经济大省中心城市，既可直接接受中心城市的辐射和支持，又有利于总体布局和发展。开发区交通便捷，集水路、公路、铁路、国际航空为一体：

水路：依托中国内河最大的外贸港口——新生圩港，是万吨海轮长江停泊的最后一站，是上海国际航运中心本枢纽港，担负着长江中上游六大省市地区的外贸物资的中转和集散任务。其常年水深12米以上，可同时停靠12艘2.5万吨级以上海轮。辟有10多条国际航线，辐射到78个国家和地区的188个港口。现已建成集装箱、件杂货、散货和液体化工等码头，货物年吞吐能力为1000万吨，集装箱年吞吐能力30万标箱。

铁路：南京城北铁路环线直通开发区及港区，通过华东地区最大的铁路枢纽尧化门编组站，与津浦、沪宁、皖赣铁路干线相连，货物进出快速便捷。

公路：南京长江二桥穿区而过，栖霞大道和二桥高速公路将开发区与南京绕城公路、机场高速以及南京市周围六条国道（宁沪、宁杭、宁马、宁合、宁连、宁通高速）连为一体，形成立体交叉的现代化陆路运输网络。

航空：开发区距南京禄口国际机场50公里，沿二桥高速、绕城公路和机场高速公路30分钟即可抵达。

地铁：南京地铁一号线二期工程终点站将延伸至开发区

公交：已开通3条线路直达市区。